Gli uffici del Fly Team subiscono un attentato. La trafficante d'armi Olivia Thornton riesce a scappare e per Forrester ed i suoi rintracciarla si rivela fondamentale per prendere l'attentatore.
Forrester e Powell, sotto copertura, si sono fatti arrestare e rinchiudere in un carcere in Libia per liberare un ex agente dell'F.B.I. Vo dirige le operazioni dalla nuova Centrale ricostruita dopo l'esplosione.
A Monaco, una donna viene assassinata durante la festa di compleanno della figlia. L'assassino la ricattava da tempo, esperienza che l'aveva resa una madre iperprotettiva.
L'F.B.I. intercetta un fuggitivo americano a Sofia, in Bulgaria, dove ha ripreso le sue attività illecite. In lui, Powell rivede un'ossessione del passato che non riesce a dimenticare.
Un ex membro del Gabinetto americano vende all'Iran un'arma informatica in grado di creare un disastro nucleare. L'accaduto porta Forrester a decidere di allontanare Powell dalla Fly Team.