Paolo Naso è docente di Scienza politica. Insegna anche presso  I'Istituto Interdisciplinare Religioni e culture della Pontificia Università Gregoriana.
E' stato a lungo direttore del mensile "Confronti" e della rubrica TV "Protestantesimo": in queste funzioni si è occupato del ruolo delle religioni in diversi scenari internazionali: in particolare il Medio Oriente, l'Irlanda del Nord, i Balcani, il Sud Africa e gli Stati Uniti da dove ha realizzato  molti servizi giornalistici. Nel 2007 è stato Visiting Professor alla Divinity School della Wake Forest University del North Carolina.
Collabora regolarmente con le riviste "Jesus" e "Confronti"