Ep. 7: L'arresto e il processo di Remigio aiutano Bernardo Gui a far fallire la Disputa e, anzi, a coinvolgere i francescani stessi nell'accusa di eresia. Il cellario viene sottoposto dall'inquisitore ad un duro interrogatorio, intervallato da numerose torture, che porta il monaco a confermare tutte le accuse che gli sono mosse. Malachia, intanto, riesce a mettere le mani sul libro scomparso e a riportarlo al sicuro nella biblioteca. Ep. 8: Adso non si dà pace per il destino della ragazza e chiede a Guglielmo di fare di tutto per aiutarla. Baskerville ha due strade davanti a sé: persuadere Bernardo Gui o risolvere il mistero della biblioteca, per provare che i due prigionieri non sono direttamente coinvolti nelle misteriose morti dei monaci. Ma, mentre i francescani abbandonano l'abbazia per andare ad Avignone e Guglielmo cerca l'inquisitore per parlargli, durante la messa Malachia cade improvvisamente a terra.